V Conference of the Central European Network, CEN2023, Basel 3-7.09.2023
Statistical methods to analyse the structure of the microbiome based on cereal leaf beetle (Oulema melanopus) data. (invited talk as a keynote speaker)
VII Ogólnopolskie Sympozjum Naukowe – “Metagenomy różnych środowisk”, Lublin 20-21.06.2023
Bakterie jelitowe owadów wspomagające wzrost roślin pomidora (Solanum lycopersicum L.). (in Polish). Together with: Krawczyk K., Przemieniecki S. W., Szymańczyk M., Obrępalska-Stęplowska A.
Insektycydy z różnych klas chemicznych zmieniają strukturę, bioróżnorodność bakterii związanych ze skrzypionką. (in Polish). Together with: Wielkopolan B., Obrępalska-Stęplowska A.
Konferencja Ochrony Roślin; 62. Sesja Naukowa Instytutu Ochrony Roslin - Państwowego Instytutu Badawczego, Poznań 15-16.02.2023
Wpływ insektycydów na strukturę Top Biome bakterii zasocjowanych z larwami skrzypionek dla poziomu taksonomicznego rodzina. (in Polish). Together with: Wielkopolan B., Małas S., Obrępalska-Stęplowska A.
VI Ogólnopolskie Sympozjum Naukowe – “Metagenomy różnych środowisk”, Puławy 23-24.06.2022 Wpływ insektycydów na mikrobiom larw Oulema spp. (in Polish). Together with: Wielkopolan B., Krawczyk K., Obrępalska-Stęplowska A.
VI Polski Kongres Genetyki, Kraków 27-30.06.2022
Cryptorchidism has a strong effect on gene expression patterns in canine testes. Together with: Stachowiak M., Nowacka-Woszuk J., Krzemińska P., Zyprych-Walczak J., Nowak T., Sosiński O., Świtoński M.
Konferencja Ochrony Roślin; 62. Sesja Naukowa Instytutu Ochrony Roslin - Państwowego Instytutu Badawczego, Poznań 16-18.02.2022
Oulema sp. jako potencjalny wektor bakterii patogenicznych zbóż (in Polish). Together with: Wielkopolan B., Krawczyk K., Baran M., Obrępalska-Stęplowska A.
XXIX Międzynarodowy Kongres Medycyny Weterynaryjnej Małych Zwierząt PSLWMZ, Łódź 19-11.2021
Zaburzenia rozwoju płci samic psa i kota - spojrzenie genetyka. (in Polish) Together with: Nowacka-Woszuk J., Szczerbal I., Stachowiak M., Szydłowski M., Zyprych-Walczak J., Nowak T., Niżański W., Dzimira S., Łukomska A., Houszka M., Gogulski M., Stachecka J., Badura M., Świtoński M.
Wnętrostwo psów - poszukiwanie predysponujących markerów genetycznych. (in Polish). Together with: Stachowiak M., Nowacka-Woszuk J., Krzemińska P., Zyprych-Walczak J., Nowak T., Sosiński O., Woga W., Świtoński M.
IX Zjazd Towarzystwa Biologii Rozrodu : Konferencja on-line, Poznań 02-04.09.2021
Whole genome sequencing in searching for genetic background of disorders of sex development in French Bulldog, American Stafford Terrier and Yorkshire Terriers dogs. Together with: Nowacka-Woszuk J., Stachowiak M., Szczerbal I., Szydlowski M., Zyprych-Walczak J., Nowak T., Krzeminska P., Świtonski M.
Extensive differences of gene expression profiles between descended and undescended canine testes revealed by whole transcriptome sequencing (RNA-seq). Together with: Stachowiak M., Zyprych-Walczak J., Nowak T., Krzeminska P., Sosinski O., Nowacka-Woszuk J., Świtonski M.
Konferencja Ochrony Roślin; 61. Sesja Naukowa Instytutu Ochrony Roslin - Państwowego Instytutu Badawczego, Poznań 10-12.02.2021
Identyfikacja bakterii związanych z Oulema spp. w zależności od stadium rozwojowego, uprawy oraz lokalizacji. (in Polish) Together with: Wielkopolan B., Krawczyk K., Baran M., Roik K., Obrępalska-Stęplowska A.
ICCVS Fall Scientific Symposium 2018, Gdańsk 14-15.11.2018
Statistical Analysis of RNA-seq Data - Bringing Results to Scientists (invited talk). Together with Zyprych-Walczak J.
The International Conference on Trends and Perspectives in Linear Statistical Inference - LinStat’2018, Będlewo k. Poznania 20-24.08.2018
Statistical methods for genes selection based on RNA-seq coverage profiles. Together with: Okoniewski M., Siatkowski I.
Effect of gene-gene correlation in RNA-seq data analysis. Together with: Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., Leśniewska A., Okoniewski M.
The 29th International Biometric Conference - IBC2018, Barcelona 08-13.07.2018
The difficult genes and their impact on RNA-seq data analysis. Together with: Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., Okoniewski M.
The 47th International Biometrical Colloquium, Kiry k. Zakopanego 10-14.09.2017
Implementation of testing the parallelism for four-parameter logistic model in R. Together with: Zyprych-Walczak J., Siatkowski I.
16th International conference of Critical Assessment of Massive Data Analysis - CAMDA 2017, Praga 22-23.07.2017
Analysis of CAMDA RNA-seq data with the knowlegde of protein domains in genes. Together with: Leśniewska A., Zyprych-Walczak J., Okoniewski M.
RBioMeSs – R and Bioinformatics/Medical statistics, Warszawa 24.11.2016
Dyskusja biologa ze statystykiem w towa-rzystwie R - czyli jak znaleźć przydatne informacje w bezmiarze danych biologicznych. (invited talk) Together with: Zyprych-Walczak J.
IV Kongres Onkologii Polskiej, Łódź 12-15.10.2016
Zmiany w ekspresji szlaków sygnałowych uczestniczące w wykształcaniu nabytej w obecności erytropoetyny oporności na cisplatynę i paklitaksel w komórkach ludzkiego raka jajnika (in Polish). Together with: Szenajch J., Góralski M., Świercz A., Zyprych-Walczak J., Synowiec A., Siatkowski I., Handschuh L.
European R Users Meeting - eRum 2016, Poznań - organiser 12-14.10.2016
LXXXI Zjazd Naukowy Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego, Warszawa 21-23.09.2016
Accuracy of the selected linear models applied for estimation of the heritability coefficient in the dairy cattle population. Together with: Różalska-Zawieja J., Nienartowicz-Zdrojewska A., Sobek Z., Siatkowski I., Zyprych-Walczak J.
Herds influence of the heritability of pregnency length in the dairy cattle population. Together with: Różalska-Zawieja J., Nienartowicz-Zdrojewska A., Sobek Z., Siatkowski I., Zyprych-Walczak J.
Influence of the paternity group size of the heritability of pregnancy length in dairy cattle population.Różalska-Zawieja J., Nienartowicz-Zdrojewska A., Sobek Z., Siatkowski I., Zyprych-Walczak J.
The 46th International Biometrical Colloquium, Lublin 05-07.09.2016
Statistical methods for survival data analysis. Together with: Siatkowski I., Zyprych-Walczak J.
BioInformatics in Torun 2016 - BIT16, Toruń 16-18.06.2016
Influence of the primary analysis on discovering differentially expressed genes based on RNA-Seq data. Together with: Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., Okoniewski M.
Nowe osiągnięcia polskich zespołów badawczych w dziedzinie genetyki, hodowli i biotechnologii roślin, Międzyzdroje 08-10.06.2016
Analiza zmienności genotypów kolekcyjnych soi pod kątem ich przydatności do hodowli w warunkach Polski. Together with: Nawracała J., Kurasiak-Popowska D., Siatkowski I.
XIII Poznan Academic Meeting of R Users - PAZUR 13, Poznań 14.01.2016
Analiza i wizualizacja danych pochodzących z głębokiego sekwencjonowania na przykładzie pakietu ampliQueso (in Polish).
RNA-Seq: strategie przetwarzania i interpretacji danych - warsztat, Poznań - participant 28.09.2015
The 45th International Biometrical Colloquium, Dymaczewo 2015 07-09.09.2015
The comparison of the normalization methods for RNA-Seq data analysis. Together with: Zyprych-Walczak J., Handschuh L., Górczak K., Klamecka K., Figlerowicz M. and Siatkowski I.
X Poznan Academic Meeting of R Users - PAZUR X, Poznań - participant 10.04.2015
IX Poznan Academic Meeting of R Users - PAZUR IX, Poznań - participant 11.02.2015
XL Konferencja Statystyka Matematyczna, Będlewo 30.11-05.12.2014
Przegląd problemów i metod związanych z analizą danych dotyczących ekspresji genów na podstawie eksperymentu głębokiego sekwencjonowania. Together with: Zyprych-Walczak J. and Siatkowski I.
Polski Akademicki Zlot Użytkowników R - PAZUR 2014, Poznań 15-17.10.2014
Wstęp do R - workshop lecturer together with Zyprych-Walczak J.
Wykorzystanie R w analizie danych RNA-seq. Together with Zyprych-Walczak J.
Sygnatury genowe chorób - użycie równoległego R i uczenia maszynowego z MLInterfaces. Together with Wiewiórka M., and Okoniewski M.
X Working Seminar on Statistical Methods in Variety Testing, Będlewo 30.06-04.07.2014
RNA-Seq plant data analysis. Together with: Górczak K., Klamecka K., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I.
Wykłady otwarte ze statystyki, UAM Poznań 21.05.2014
Statystyczna analiza danych pochodzących z eksperymentów mikromacierzowych i sekwencjonowania nowej generacji (in Polish). Together with: Zyprych-Walczak J., Klamecka K., Górczak K., Siatkowski I.
VII Poznan Academic Meeting of R Users - PAZUR VII, Poznań - participant 11.05.2014
VI Poznan Academic Meeting of R Users - PAZUR VI, Poznań - participant 14.03.2014
2nd International Congress of Rare and Orphan Diseases - RE(ACT) CONGRESS 2014, Bazylea 05-08.03.2014
True Haploinsufficiency in Rare Aortic Diseases: Identification and Characterization of large Deletions using Next Generation Sequencing. Together with Meienberg J., Okoniewski M., Patrignani A., Tsai Y.C., Carrel T., Steinmann B., Turner S.W., Korlach J., Röthlisberger B., Schlapbach R., Matyas G.
V Poznan Academic Meeting of R Users - PAZUR V, Poznań - participant 30.01.2014
IV Poznan Academic Meeting of R Users - PAZUR IV, Poznań - participant 13.12.2013
Seminar of the Bioinformatics Group, BOKU University Vienna 26.11.2013
Microarray vs RNA-seq - novel appoaches for searching interesting genes (invited talk). Together with: Zyprych-Walczak J.and Siatkowski I.
18th European Young Statisticions Meeting, Osijek - polish representant 26-30.08.2013
Statistical methods for RNAseq coverage profiles and their applications in biological phenomena. Together with Siatkowski I., Okoniewski M.
European Bioconductor Developers’ Meeting 2012, Zurich 13-14.12.2012
Nonparametric tests on RNAseq coverage profiles.
Swiss Institute of Bioinformatics, Lozanna - participant 12.10.2012
Course: Integration of data from different omics.
Huber’s Group Seminar, Heidelberg 25.09.2012
Coverage-based methods in the secondary analysis of the RNA-Sequencing data. (invited talk)
European Molecular Biology Labolatory, Heidelberg - participant 24-26.09.2012
Advanced Course: Towards Next-Generation Sequencing Data Integration.
ECCB12 - European Conference on Computational Biology, Bazylea - participant 08-12.09.2012
II Poznański Akademicki Zlot Użytkowników R - PAZUR 2.0, Poznań - participant 12.05.2012
Kongres Statystyki Polskiej, Poznań 18-20.04.2012
Metody selekcji genów uwzględniające korelację pomiędzy genami (in Polish). Together with: Zyprych-Walczak J. and Siatkowski I.:
Poznański Akademicki Zlot Użytkowników R - PAZUR, Poznań - participant 05.03.2012
European Bioconductor Developers’ Meeting 2011, Manchester 08-09.12.2011
Measures of dissimilarity of the coverage functions. together with: Okoniewski M. J., Leśniewska A., Zyprych-Walczak J.
CEN 2011 Bridging Biostatistical Theory and Application, Zurich 12-16.09.2011
Linear Mixed Model in Gene Selection Problem. Together with Siatkowski I.
XLI International Biometricum Colloquium, Lublin 05-08.09.2011
Wykorzystanie liniowego modelu mieszanego w problemie selekcji genów. Together with Zyprych-Walczak J. and Siatkowski I.
Wrocławski Zlot Użytkowników R (WZUR 3.0), Wrocław 24-25.09.2010
Selected multivariate mixed models.
XL International Biometrical Colloquium and Second Polish-Portuguese Workshop on Biometry in honour of Prof. J.T. Mexia, Bedlewo 29.08-03.09.2010
Gene’s selection based on statistical tests. Together with: Zyprych J. and Siatkowski I.
Overview of growth models in R. Together with: Siatkowski M., Goszczurna T. and Zyprych J.
Morfological analysis of inflorescence mutants in alfalfa (Medicago sativa L.sl.) with the respect to seed yield traits. Together with: Weigt D., Zyprych J., Siatkowski I. and Broda Z.
Analiza zróżnicowania genetycznego odmian i klonów koniczyny białej (Trifolium Repens L.) przy użyciu markerów molekularnych. Together with: Tomkowiak A., Zyprych J., Broda Z. and Siatkowski I.
Tutorial workshop “Robustness: Basic Concepts and Applications”, Praga - participant 26-27.06.2010
30th International Study Group Mathematics with Industry 2010, Amsterdam 25-29.01.2010
participation finished with publication: Thornton A., Szabelska A., Zyprych J. et. al. (2010) Modeling and optimization of algae growth. Proceedings of the 72nd European Study Group - Mathematics with Industry, 54-85.
14th Quantitative Trait Locus and Marker Assisted Selection Workshop, Poznań - participant 17-18.05.2010
Statystyka Matematyczna - WISłA ’09, Wisła 07-11.12.2009
Wybrane testy statystyczne w selekcji genów. Together with: Siatkowski I. and Zyprych J.
Microarrays in the analysis of expression of genes: The tool in the basic and clinical researches, Gliwice - participant 18-20.11.2009
12th International Workshop for Young Mathematicians - “Probability Theory and Statistics”, Kraków - participant 21-25.09.2009